马克思主义学院前身为原惠阳师范专科学校马列室。2006年3月，学校独立设置思想政治理论课教学部。2016年10月，学校以思想政治理论课教学部为基础成立马克思主义学院。2018年3月，思想政治教育专业从政法学院整体转入马克思主义学院。
学院下设6个思想政治理论课教研室以及1个思想政治教育专业系，主要承担全校学生思想政治理论课教学、思想政治教育专业人才培养、马克思主义理论学科建设、研究和宣传党的创新理论等职能任务。
学院拥有一支师德高尚、结构合理、业务精湛的师资队伍。现有教职工60人，其中专任教师55人，教授4人，副教授17人；高级职称教师占比40%，博士学位教师35人、占比60%；硕士生导师4人；“双师双能型”教师25人，占比45%；兼职教师7人，外聘客座教授2名。
学院积极推进思想政治理论课教学改革。坚持思政课建设与党的创新理论武装同步推进，探索形成“教学内容专题化”“教学方式多样化”“实践教学立体化”“教学评价多元化”的“四化”教学模式，着力把思想政治理论课办成落实立德树人根本任务的关键课程和铸魂育人的第一课堂。建有广东省优质思想政治理论课3门；近年来获广东省哲学社会科学优秀成果奖2项，广东省大中小学思政课一体化教学展示交流活动、广东省高校思想政治理论课青年教师教学基本功比赛等奖项5项。
学院坚持以学科建设为引领推动有组织科研。设有“广东省革命老区（惠州）研究中心”“惠州市学校思想政治工作研究与指导中心”“惠州市城乡融合发展战略研究基地”“惠州学院台湾研究所”等科研平台。近三年完成各类科研项目40项，其中纵向课题32项，横向课题8项，国家社科基金项目1项，省部级项14项；共发表论文52篇，其中高水平论文37篇，出版著作4部。
学院坚持以学生为中心不断提升人才培养质量。思想政治教育专业不仅重视学生专业素养的提升，更突出学生品格养成、人生价值、社会责任的教育，力行“一践行三学会”理念（即践行师德，学会教学、学会育人、学会发展），致力于培养让党放心、爱国奉献、担当民族复兴重任的时代新人。现有在校本科生300余人，与华南师范大学联合培养教育硕士(学科教学•思政)研究生。近年来学生在国家级、省级师范生教学技能比赛，省级大学生“挑战杯”竞赛等大赛中获奖50多项；40多人考取清华大学、中国人民大学、南京大学、中山大学、华南师范大学等国内名校硕士研究生。
学院院训：“求真、悟道、笃行”。